1 Bibliothèque de l’Institut Ms 3139/20, Antoine-Laurent de Jussieu, État de la botanique depuis 1789, 31 juillet 1807.
2 Lettre de Jussieu à Le Monnier du 3 mars 1787, fonds non classé BC MNHN.
3 Catalogue de l’Herbier de Antoine-Laurent de Jussieu, 1858, archivé à l’Herbier national du Muséum national d’Histoire naturelle, https://science.mnhn.fr/catalogue/bota-jussieu-1/, consulté le 11/03/2018 ; BC MNHN Ms 1062 : « Clef de la classification de l’herbier, ou exposé de la méthode Jussieu » ; Lasègue 1845 ; Stafleu 1964 : xxx-xxxii ; Lourteig & Jovet 1997.
4 Il existe évidemment des intersections entre ces différentes collections.
5 Bibliothèque de l’Institut Ms 3139/20, Antoine-Laurent de Jussieu, État de la botanique depuis 1789, 31 juillet 1807.
6 Ensembles de communautés végétales et animales qui composent les écosystèmes majeurs, à l’échelle continentale. Les différents biomes portent le nom des communautés végétales qui les caractérisent. La biogéographie décrit généralement 14 biomes terrestres (Udvardy 1975).
7 La famille des Urticaceae par exemple, famille de l’ortie créée par Jussieu, n’est représentée en Europe que par quelques plantes herbacées annuelles ou vivaces, alors qu’elle comprend dans les zones tropicales des genres d’arbres, d’arbustes et de lianes. À ce propos, Jussieu remarque d’ailleurs que « la série des arbres indigènes de l’Europe n’est pas étendue. Elle est déjà surpassée par celle des arbres exotiques acclimatés en Europe » (Jussieu Bibliothèque de l’Institut Ms 3139).
8 Les mers ainsi que les reliefs constituent les principales barrières géographiques pour les espèces (Spichiger et al. 2016 : 37-38).
9 Voir 2.2.1.
10 En 1771, les 3 400 volumes de la bibliothèque de Jean-Jacques Dortous de Mairan, ancien secrétaire perpétuel de l’Académie des sciences, sont vendus en bloc pour 10 000 livres (Roche 1969 : 47).
11 http://histoire-bibliophilie.blogspot.fr/2014/05/les-ventes-publiques-de-livres-paris-au_20.html. Consulté le 20/06/2015. La bibliothèque d’Arago, vendue en juin 1854, est composée de « seulement » 2 225 lots.
12 Sans information sur cette question, nous supposerons que la date de parution correspond, à quelques mois près, à la date d’entrée dans la bibliothèque.
13 Bibliothèque de l’Institut Ms 3139/20, Antoine-Laurent de Jussieu, État de la botanique depuis 1789, 31 juillet 1807.
14 Johann Reinhold Forster (1729-1798) et son fils Georg Forster (1754-1794).
15 Jussieu semble s’être brièvement intéressé aux travaux de Priestley, car il apparait en 1777 comme souscripteur du volume 2 de la traduction des Experiments and Observations on Different Kinds of Air. Expériences (Priestley 1775). Toutefois, le volume est absent du catalogue de la bibliothèque. Le botaniste aurait pu lire dans le volume 1, en réponse à certaines interrogations émises dans sa thèse : « ce qui me persuade qu’on peut inférer avec certitude que les plantes sont capables de rétablir parfaitement l’air vicié par la respiration ». La thèse de Priestley est encore plus convaincante dans la formulation originale : « it is highly probable that the injury which is continually done to the atmosphere by the respiration of such a number of animals, [… ] is, in part at least, repaired by the vegetable creation » (Priestley 1775 : 92-93).
16 Les 22 carnets de démonstration de Jussieu forment également une base de données primordiale, par le double index des synonymies qu’ils contiennent, ainsi que par les références croisées aux ouvrages plus anciens traitant de la même espèce ou du même genre.
17 Ces genres appartiennent aux familles jusséennes des Ranunculaceae, Dipsacaceae, Geraniaceae, Gentianaceae, et Rosaceae. De nos jours, les valérianes sont intégrées à la famille des Caprifoliaceae.
18 Dans la terminologie moderne, Poaceae, Liliaceae, Lamiaceae, Asteraceae, Apiaceae, Brassicaceae, Fabaceae.
19 En 1824, à la suite des travaux de Joseph Gærtner et de son fils Karl Friedrich Gærtner, Jussieu augmentera le nombre de caractères tertiaires, notamment ceux liés au fruit et à la graine. Il apportera également une définition plus précise des caractères quaternaires : forme, grandeur, couleur de plusieurs parties, disposition des fleurs, feuilles considérées comme simples ou composées, sessiles ou pétiolées, radicales ou caulinaires (Jussieu 1824 : 30-31).
20 L’aperture se définit comme la ou les ouverture (s) ou zone (s) d’amincissement de la paroi externe du grain de pollen, permettant la sortie du tube pollinique. Les détails à observer ne mesurent que quelques micromètres, et nécessitent l’utilisation d’un microscope électronique à balayage, technologie développée à la fin des années 1960.
21 Nous n’étudierons pas ici le fondement du principe d’analogie, utilisé par Jussieu de manière incidente dans son régime de preuve, et déjà suspect pour la communauté savante de la seconde moitié du XVIIIe siècle, qui ne lui confère plus qu’un pouvoir explicatif et didactique. En revanche, il est fort probable que le raisonnement par analogie a joué un rôle essentiel pour son oncle Bernard, dans la conception initiale du modèle taxonomique.
22 Voir, par exemple, les nouvelles familles formées lors de la replantation de l’École de botanique et supprimées par la suite, du fait de l’observation d’espèces nouvelles.
23 Il est indubitable, à la fois pour les contemporains de Bonnet et pour l’historiographie récente, que Leibnitz est le premier philosophe de la période moderne à décrire une « chaîne des corps naturels » en dehors de toute tentative théologique, idée qui a traversé l’histoire des sciences sous des formes diverses, dans des contextes épistémiques les plus variés (voir par exemple Barsanti 1992 : 65 ; Roger 1995 : 239-240 ; Duprey 2011 : 618-619).
24 Au sein de cette communauté, certains toutefois ignorent cette représentation de la nature, comme Réaumur, ou la refusent comme Voltaire, avec deux arguments distincts : il existe dans la hiérarchie de la chaîne des êtres des distances irréductibles comme celle entre le singe et l’homme, ou entre l’homme et Dieu, qui induisent des discontinuités ; de plus, la disparition constatée d’espèces animales ou végétales provoque nécessairement des interruptions, des vides, dans la chaîne des êtres (Voltaire 1765).
25 En 1792, Paul Giseke (1741-1796), étudiant de Linné, publiera une carte des affinités généalogico-géographiques des plantes (Tabula genealogico geographica affinitatum plantarum) qui reflète les résultats des comparaisons morphologiques utilisées par le maître et ses élèves pour établir les affinités naturelles entre les genres de plantes (Giseke 1792).
26 À partir de la fin du siècle, Lamarck s’éloignera définitivement d’une échelle linéaire des êtres par la mise en série évolutive des différentes classes d’invertébrés.
27 Dans le chapitre 10 de l’Historia Plantarum consacré à la fleur, Ray cite et reprend à son compte l’opinion de Nehemiah Grew concernant le rôle des étamines comme fonction mâle de la reproduction. Il présente également diverses observations sur des espèces à « sexe différent », nous dirions dioïques, saule, palmier… Quelques années plus tard, Camerarius confirmera expérimentalement le rôle fertilisant du pollen (Camerarius 1694).
28 Traduction Marcel Blanc in Mayr 1989 : 251.
29 Dans son Essay Concerning Human Understanding, Locke reprend les termes de l’ancien débat des universaux, et dans un dialogue qui l’oppose à Leibnitz, affirme une position nominaliste (Locke 1690 ; Roger 1995 : 200-201 ; Belhoste 2016 : 173-175). À la suite de Locke, Bonnet conteste le caractère réel des espèces. « Les couleurs du Prisme », métaphore ultime de la chaine des êtres, n’autorisent aucune délimitation dans les teintes et les couleurs, et toutes les classes dont le naturaliste fait usage pour ordonner le monde vivant ne sont qu’artificielles (Bonnet 1764 II : 76-77 ; Duprey 2011 : 629-630).
30 « Un individu, de quelque espèce qu’il soit, n’est rien dans l’univers […] les espèces sont les seuls êtres de la nature » (Buffon 1765 XIII : j).
31 BC MNHN MS 1809-1830.
32 BC MNHN MS Jus 28, Manuscrit botanique inédit. Le feuillet de couverture porte, de la main d’Adrien de Jussieu : « Ce manuscrit a été trouvé dans un tiroir du bureau d’Antoine-Laurent de Jussieu. L’écriture ressemble un peu à celle de Bernard jeune mais elle paraît bien être d’Antoine-Laurent ». Il est assez facile de dater ce manuscrit (1771-1772), par l’analyse de l’écriture de Jussieu jeune, conjuguée à l’utilisation de la nomenclature plurinominale pré-linnéenne pour dénommer les espèces.
33 BC MNHN MS 1204.
34 BC MNHN MS 279-281 ; BC MNHN MS 1904 ; BC MNHN MS 198 ; BC MNHN MS 1013 ; BC MNHN MS 1226 ; BC MNHN MS 1343. Yves Laissus a donné une description détaillée de l’ensemble du fond Commerson déposé au Muséum (Laissus 1978).
35 BC MNHN MS 198 ; BC MNHN MS 1013 par exemple.
36 BC MNHN MS 1343, p. 89. Le Badamier, Terminalia catappa est classé de nos jours dans la famille des Combretaceae. Le faux benjoin, Terminalia bentzoë, appartient effectivement au même genre.
37 In-folio : hauteur de la page entre 30 cm et 40 cm - Grand in-folio : plus de 40 cm.
38 BC MNHN MS 279, dossier 3.
39 BC MNHN MS 1226/2, Nova genera Commersoniana.
40 Une métadonnée est une donnée qui sert à décrire, à caractériser, à définir, ou à qualifier une autre donnée. Un jeu de métadonnées est un ensemble structuré d’informations qui caractérise et qualifie un ensemble de ressources informationnelles.
41 BC MNHN Ms 3338. Nova plantarum americanarum genera de Charles Plumier, 1703. Exemplaire annoté par Antoine et Bernard de Jussieu auquel est joint un cahier manuscrit contenant une table de concordance des planches de Plumier, de la main d’Antoine-Laurent de Jussieu. La plupart des 4 000 dessins de végétaux réalisés par Plumier, excellent dessinateur, n’ont jamais été publiés. Ils constituent un matériau important pour Jussieu, qui dispose dans son cabinet de toute la collection ; ils sont cités comme une des sources utilisées pour la rédaction du Genera Plantarum (Jussieu 1789 : 4).
42 BC MNHN MS 1204, folio 1. Adrien de Jussieu a ajouté cette seconde note, sous les commentaires de son père : « Ce catalogue diffère en beaucoup de points de ceux qui précèdent et se rapproche davantage du Genera, pour la rédaction duquel il fut fait. »
43 BC MNHN MS 1204, pp. 78-88.
44 Lettre d’Antoine-Laurent de Jussieu à Le Monnier du 3 mars 1787, fonds non classé BC MNHN.
45 Commerson a fait un voyage d’herborisation à Madagascar en 1770.
46 BC MNHN MS 1904, cahier n° 3, Labor botanicus in Gallicana Insula, Anno 1772, Commerson Nat. Regius, p. 1.
47 BC MNHN MS 279, dossier 3.
48 Lettres de Dombey à Jussieu du 20 avril 1779 et du 20 avril 1780 (Hamy 1905 : 252-257).
49 BC MNHN MS 279, dossier 3.
50 BC MNHN MS 1226/2, folio 2. Musae, dénommée de nos jours Musaceae, correspond à la famille du bananier.
51 Le second voyage dura trois ans, de juillet 1772 à 1775. Les Forster remplacèrent Banks, qui s’était désisté au dernier moment, comme botaniste. Leur exemple inspirera Alexander von Humboldt et Darwin.
52 BC MNHN MS 1226/2, folios 6 et 8.
53 BC MNHN MS 1204, pp. 89-89bis, 94.
54 En 1829, Barthélemy Dumortier (1797-1878), naturaliste belge, propose la création de la famille des Taccaceae. La position taxonomique de la famille des Narcissis et des Taccaceae fera toutefois l’objet de nombreuses spéculations pendant 180 ans. En 2009, la classification phylogénétique APG III invalide la famille et rattache finalement le genre Tacca à la famille des Dioscoreaceae. En 2017, la dernière classification APG IV (re) valide la famille des Taccaceae. La planche d’herbier du Villeria/Tacca, collectée en 1772 par Commerson (MNHN-P-P00672509, figure 4 21), a été définitivement identifiée en 1913 comme Tacca madagascariensis (Tacca leontopetaloides).
55 Indubitablement Jussieu porte une responsabilité majeure dans la non publication des travaux complets de Commerson. Seuls figurent dans le Genera Plantarum les 47 genres (nouveaux) ainsi que le dédommagement très partiel constitué par l’hommage en exergue. Lamarck en publiera toutefois un certain nombre dans l’Encyclopédie méthodique, et une partie du travail de Jussieu après la Révolution consistera à rédiger une série d’études détaillées sur les genres découverts par le botaniste voyageur, son herbier et ses manuscrits servant à la rédaction complète ou partielle de 35 diagnoses supplémentaires.
