Table des matières
Jean Garbaye
Préface
2. Méthodes d’étude des champignons ectomycorhiziens et des ectomycorhizes
- INTRODUCTION
- RÉCOLTE, DESCRIPTION ET CONSERVATION DES SPOROPHORES
- Sur le terrain
- Récolte
- Annotation
- Photographie
- Transport des échantillons
- En laboratoire
- Fiche de description
- Représentation
- Description
- Chapeau
- Lames
- Tubes
- Stipe
- Chair
- Herbier
- Recommandations
- ISOLEMENT DU MYCÉLIUM DES CHAMPIGNONS ECTOMYCORHIZIENS
- Isolement du mycélium des sporophores
- Isolement du mycélium des spores
- Caractérisation morphologique des ectomycorhizes et isolement du mycélium
- Isolement du mycélium des sclérotes
- Collection de champignons ectomycorhiziens en culture
- CARACTÉRISATION MOLÉCULAIRE DES SPOROPHORES ET DES ECTOMYCORHIZES
- Récolte et conservation
- Préparation des diverses solutions
- Préparation du CTAB 2x
- Extraction et purification de l’ADN total
- Quantification et vérification de la pureté de l’ADN extrait
- Amplification enzymatique de l’ADN par PCR
- Principe
- Milieu réactionnel
- Préparation des amorces
- Conditions de la PCR
- Migration par électrophorèse sur gel d’agarose
- Polymorphisme de longueur des fragments de restriction
- Principe
- Milieu réactionnel
- Migration des fragments par électrophorèse sur gel d’agarose
- Séquençage de l’ADN
- Principe
- Purification de l’ADN à séquencer
- Quantification de l’ADN
- Réaction de séquence
- Milieu réactionnel
- Conditions de la PCR
- Purification des produits d’extension
- Analyse des séquences
- SYNTHÈSE MYCORHIZIENNE
- Synthèse axénique
- Germination des graines
- Synthèse en tube
- Inoculation par des implants mycéliens
- Inoculation par une suspension mycélienne
- Synthèse en boîte de Petri
- Synthèse non axénique
- Synthèse en minirhizotron
- Synthèse en sachet plastique
- Observation de la structure et de l’ultrastructure des ectomycorhizes
- Fixation
- Déshydratation et inclusion
- Observation
- PRODUCTION D’INOCULUM ET INOCULATION
- Inoculums naturels
- Inoculums contrôlés
- Inoculum solide sur tourbe et vermiculite
- Inoculum type bille d’alginate
- Production de la biomasse fongique
- Processus d’inclusion du mycélium dans l’alginate de sodium
- Supports culturaux pour la mycorhization contrôlée
- CONCLUSION
3. Diversité des champignons ectomycorhiziens et des ectomycorhizes des arbres forestiers natifs d’Afrique de l’Ouest
- INTRODUCTION
- STATUT MYCORHIZIEN DES FORÊTS TROPICALES NATURELLES
- STATUT ECTOMYCORHIZIEN DES ARBRES NATIFS D’AFRIQUE TROPICALE
- DISTRIBUTION PHYTOGÉOGRAPHIQUE DES ARBRES ECTOTROPHES EN AFRIQUE TROPICALE
- MONODOMINANCE DES ARBRES ECTOTROPHES EN AFRIQUE TROPICALE
- DESCRIPTION BOTANIQUE D’ARBRES ECTOTROPHES EN AFRIQUE DE L’OUEST
- Afzelia africana Smith
- Afzelia bella Harms
- Afzelia bracteata T. Vogel ex Benth.
- Anthonotha crassifolia (Baill.) J. Léonard
- Anthonotha fragans (Bak. F.) Exell et Hillcoat
- Anthonotha macrophylla P. Beauv.
- Berlinia grandiflora (Vahl) Hutch. & Dalz.
- Cryptosepalum tetraphyllum (Hook. f.) Benth.
- Gilbertiodendron limba (Scott Elliott) J. Leonard
- Isoberlinia dalziellii Craib & Stapf
- Isoberlinia doka Craib & Stapf
- Monotes kerstingii Gilg.
- Uapaca chevalieri Beille
- Uapaca esculenta A. Chev. Ex-A. Aubr. et Léandri
- Uapaca guineensis Müll. Arg.
- Uapaca heudelotii Baill.
- Uapaca somon Aubr. et Léandri
- DIVERSITÉ DES CHAMPIGNONS ECTOMYCORHIZIENS ET DES ECTOMYCORHIZES
- Sites visités
- Diversité des champignons ectomycorhiziens
- Diversité des ectomycorhizes
- CONCLUSION
4. Écologie des champignons ectomycorhiziens associés à Afzelia africana
- INTRODUCTION
- DÉTERMINISME DE LA SÉQUENCE D’APPARITION DES MORPHOTYPES ECTOMYCORHIZIENS
- Séquence d’apparition des morphotypes
- Stratégies de conservation et de dissémination des propagules
- Compétitivité du champignon précoce théléphoroïde XM002
- Compétition entre champignons précoces et tardifs
- Compétitivité du champignon précoce dans des sols forestiers
- Besoins en sucres des souches précoces et tardives
- CONCLUSION
6. Les champignons ectomycorhiziens : une source de champignons comestibles
- INTRODUCTION
- SITUATION GÉOGRAPHIQUE DE LA ZONE D’ÉTUDE
- PRINCIPAUX TYPES FORESTIERS CONCERNÉS
- ARBRES ECTOTROPHES DANS LES RÉGIONS ÉTUDIÉES
- COMESTIBILITÉ : UN CONCEPT COMPLEXE
- CHAMPIGNONS ECTOMYCORHIZIENS COMESTIBLES
- Champignons associés à des arbres ouest-africains
- Champignons associés à des arbres exotiques
- QUELQUES CAS PARTICULIERS DE CHAMPIGNONS COMESTIBLES
- Phlebopus sudanicus (Har. & Pat.) Heinem.
- Amanita bingensis (Beeli) R. Heim
- Gyrodon intermedius ined.
- CONCLUSION
